新中國成立后，他在中央農(nóng)業(yè)部的領(lǐng)導崗位上，會同貿(mào)易部副部長姚依林、辦公廳主任林海云等同志討論成立了中國第一個對外貿(mào)易公司——中國茶業(yè)出口公司（歸中央貿(mào)易部領(lǐng)導），他兼任總經(jīng)理。在當時錯綜復雜的國際形勢變化中，他迅速同蘇聯(lián)等國簽訂茶葉貿(mào)易合同；加緊組織進行茶葉的收購加工，履行易貨償債；并積極開展對資本主義市場的貿(mào)易，推銷積存茶葉；大力訂制制茶機械，在各主要茶區(qū)籌建各種類型的制茶廠；同時聯(lián)系各省積極建立和擴大茶葉教學與科研機構(gòu)等。當抗美援朝開始，美國對我國實行封鎖禁運，他又采取了綠茶改制紅茶等應變措施。隨后他召開了全國茶葉會議，制定了第一個茶葉發(fā)展計劃，為新中國的茶葉事業(yè)勾劃了宏偉細致的藍圖。此后他因調(diào)任其他工作，不再主管茶葉，但中國茶葉事業(yè)的發(fā)展和取得的成就，都直接或間接地和他的擘劃分不開。

　　在經(jīng)歷了十年“文化大革命”的浩劫后，他已年逾八十高齡，但仍積極與農(nóng)業(yè)和茶葉界人士探討問題，參與各項考察和學術(shù)活動。他親自去云南、廣西、海南等茶區(qū)做調(diào)研，建議云南、貴州、四川、廣西、廣東發(fā)展紅碎茶，以適應國際市場需要；為增強茶葉出口競爭力，他首先提出外銷紅、綠茶出口免稅的建議；統(tǒng)籌外銷茶產(chǎn)制運銷一條龍等。這些戰(zhàn)略性的意見，引起了有關(guān)部門的重視，有的已被采納實施。1983年10月，他親自到杭州參加“茶葉與健康、文化研討會”，他在講話中說：這次會“是一個創(chuàng)舉”，“茶與醫(yī)藥、文化相結(jié)合前景非常廣闊”。事實證明，我國茶文化活動從此蓬勃發(fā)展。

　　吳覺農(nóng)茶學思想研討會照片　　他生前著譯甚豐，內(nèi)容廣泛。1987年在他九十壽辰時，由中國茶葉學會、中國農(nóng)學會牽頭，集中了老一代的茶葉專家，編選了以茶葉論文為主體的《吳覺農(nóng)選集》。在晚年，他還主編了《茶經(jīng)述評》一書，對我國茶葉歷史和現(xiàn)狀作了較全面、正確的評述。他七十年來有關(guān)茶葉的論著，豐富了祖國茶葉歷史文庫。他的傳記已列入浙江省“文化名人傳記叢書”。根據(jù)他對中國茶葉事業(yè)建立的功績，以及對茶學的淵博知識、豐富的實踐經(jīng)驗和理論著述，當年陸定一同志稱譽他為“當代茶圣”，立即得到茶界以及各方面人士的普遍認同和熱烈響應。在他的實踐和理論探索基礎上，形成了中國特有的茶學思想，至今仍有現(xiàn)實的指導意義。2001年5月，由我國茶學界、茶文化界以及有關(guān)企業(yè)單位發(fā)起組織了學術(shù)性民間團體“吳覺農(nóng)茶學思想研究會”，宗旨是團結(jié)茶界專家學者和廣大的茶人、愛茶人共同探討與弘揚他的茶學思想，繁榮茶葉經(jīng)濟、茶文化，為社會主義的物質(zhì)文明和精神文明服務。